当院は五島における唯一の総合病院であるため、あらゆる患者さんが来られます。

そのため、救急を始めとしたプライマリ・ケアから、内科では心臓カテーテル検査や内視鏡治療など専門的診断、治療までの一連の流れを多数経験することができます。 外科では、癌治療をはじめ消化管穿孔やイレウスなどに対する開腹手術や腹腔鏡下手術等、整形外科においても、 クリーンルームを利用した人工骨頭置換術をはじめ切断指の再接着等のマイクロサージャリーにも対応しており、多種の症例を経験することができます。
また、１人の患者さんを五島という島で診ていこうという医療・福祉・保健施設との連携により、全人的医療の提供についても学んでいきます。

各科とも認定医、専門医を取得できるようにプログラムされています。当院は長崎大学の関連病院のため、プログラムのように希望により長崎大学での研修もできます。
また、プログラムは画一的ではなく、後期研修医の希望に沿ったものに修飾することができます。

日本呼吸器学会認定施設
日本呼吸器内視鏡学会関連施設
日本消化器内視鏡学会指導施設
日本外科学会認定医制度修練施設
日本整形外科学会認定施設
日本眼科学会認定施設
放射線科専門医修練協力機関
日本内科学会教育関連施設
日本精神神経学会認定施設
日本がん治療認定医機構認定研修施設
肝疾患専門医療機関
循環器専門医研修関連施設

当院での常勤医としての勤務あるいは長崎大学医局への入局、他の病院勤務などの道が開かれています。